Gracias Enric.
Como dices el IRPF no se debe ver afectado y no es ese el problema. Entiendo el funcionamiento del módulo que separa solo el IVA en dos partes, pero no los otros impuestos que puedan aplicarse. Justo por eso, me sorprendió que en la configuración del impuesto del IRPF, en Opciones avanzadas haya un campo Si/No con la etiqueta "Con prorrata de IVA" .
Explico lo que me ocurrió para ver si me explico mejor y puedo focalizar mi duda. Fue lo siguiente:
- al introducir una factura con un servicios IVA 21% de un proveedor que tenía la posición fiscal retención IRPF 15% asignada, no me incorporó este impuesto en el campo, solo el del IVA, lo que no me había pasado nunca en los Odoo sin prorrata.
- Al entrar en la configuración del impuesto IRPF 15 % de compra, vi que este campo estaba desactivado y en cambio el del IVA 21% sí que lo estaba.
- Probé de activar el campo en el impuesto del IRPF para ver si era esto lo que generaba este cambio de comportamiento y, efectivament, cuando añades una línea a la factura de este proveedor, incluye los dos impuestos de forma automática, (como lo hacía en mis Odoos sin prorrata (BIEN!). Pero en este caso, cuando ves los apuntes contables, efectivamente la cosa se tuerce, porque ha separado también el IRPF en dos partes, lo que no es correcto. (MAL!)

Por tanto mi duda es: en los Odoos de empresas con prorrata, ¿habrá que introducir siempre manualmente los impuestos que no sean del IVA? ¿O es que hay alguna configuración que no he hecho correctamente?